网站就实现了盈利。其实，它与外经贸部最初构想的商业模式是完全不一样的，是马云不断去说服他们一定要做这样的网站，表示这样的网站是最适合中国市场的。最终他们的努力赢得了外经贸部的同意，促成了当初迅速盈利的结果。虽然马云在外经贸部的成绩是大家公认的，是有目共睹的，但是马云仍然感到现实和理想的差距。马云在外经贸部期间虽任职中心信息部经理，但在编制上来讲仅能算一个编外人员，涉及利益的重要决定，他并没有发言权。马云发现，他跟外经贸部领导人的想法大相径庭。马云认为电子商务应该支持中小企业、私有经济，而且网站一定是开放式的，但是，他的老板认为他们要服务大型国有企业，建立内部的封闭系统。在网站定位上大的分歧让马云开始考虑他来北京的目的能否实现。马云来北京是创业的，来追寻自己的互联网梦想的，不光是来挣钱的。随着时间的流逝，马云不断地在确认他要的不是一份舒适的工作、一份高额的薪水，他想创业，他想创建一个全世界最大的商人网站。在这个过程中，雅虎杨致远向马云发来了聘请，邀请他任雅虎中国总经理；1998年底，成立不久的新浪也重金邀请马云加入，都被马云拒绝。同时，马云从外经贸部辞职准备回杭州重新进行互联网第二次独立
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